MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	CA	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	384410913
2	NC_017184	ATCTG	2	10	146	155	20 %	40 %	20 %	20 %	384410913
3	NC_017184	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	384410913
4	NC_017184	TGAG	2	8	255	262	25 %	25 %	50 %	0 %	384410913
5	NC_017184	TTG	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410914
6	NC_017184	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
7	NC_017184	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
8	NC_017184	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410914
9	NC_017184	ACC	2	6	438	443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410914
10	NC_017184	CATT	2	8	444	451	25 %	50 %	0 %	25 %	384410914
11	NC_017184	AAC	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410914
12	NC_017184	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410915
13	NC_017184	AAT	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410915
14	NC_017184	T	6	6	898	903	0 %	100 %	0 %	0 %	384410915
15	NC_017184	T	6	6	941	946	0 %	100 %	0 %	0 %	384410915
16	NC_017184	ATC	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410916
17	NC_017184	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
18	NC_017184	ATG	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
19	NC_017184	GCT	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
20	NC_017184	TAT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410916
21	NC_017184	GAC	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410916
22	NC_017184	AC	3	6	1549	1554	50 %	0 %	0 %	50 %	384410916
23	NC_017184	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
24	NC_017184	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410917
25	NC_017184	TGC	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410917
26	NC_017184	TG	3	6	1786	1791	0 %	50 %	50 %	0 %	384410917
27	NC_017184	CGC	2	6	1820	1825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410917
28	NC_017184	GGC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
29	NC_017184	TTC	3	9	1910	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
30	NC_017184	GA	3	6	1951	1956	50 %	0 %	50 %	0 %	384410917
31	NC_017184	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410917
32	NC_017184	TTC	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
33	NC_017184	CAG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
34	NC_017184	CTGAC	2	10	2054	2063	20 %	20 %	20 %	40 %	384410917
35	NC_017184	GGC	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
36	NC_017184	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410917
37	NC_017184	GCCT	2	8	2241	2248	0 %	25 %	25 %	50 %	384410917
38	NC_017184	CGA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
39	NC_017184	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
40	NC_017184	ACG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
41	NC_017184	A	6	6	2439	2444	100 %	0 %	0 %	0 %	384410917
42	NC_017184	TCAC	2	8	2488	2495	25 %	25 %	0 %	50 %	384410917
43	NC_017184	T	7	7	2989	2995	0 %	100 %	0 %	0 %	384410918
44	NC_017184	TA	3	6	3003	3008	50 %	50 %	0 %	0 %	384410918
45	NC_017184	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410918
46	NC_017184	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410918
47	NC_017184	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	384410918
48	NC_017184	GCTGCA	2	12	3191	3202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384410918
49	NC_017184	GATT	2	8	3212	3219	25 %	50 %	25 %	0 %	384410918
50	NC_017184	ATTC	2	8	3274	3281	25 %	50 %	0 %	25 %	384410919
51	NC_017184	AT	3	6	3305	3310	50 %	50 %	0 %	0 %	384410919
52	NC_017184	CAA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410919
53	NC_017184	CGA	3	9	3394	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
54	NC_017184	TCA	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
55	NC_017184	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
56	NC_017184	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
57	NC_017184	CAT	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
58	NC_017184	GAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410919
59	NC_017184	AAG	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410919
60	NC_017184	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
61	NC_017184	AGC	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
62	NC_017184	AAT	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
63	NC_017184	CAA	3	9	4134	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410920
64	NC_017184	A	6	6	4154	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	384410920
65	NC_017184	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
66	NC_017184	AGA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
67	NC_017184	CCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410920
68	NC_017184	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	384410920
69	NC_017184	ATT	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
70	NC_017184	A	6	6	4518	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	384410921
71	NC_017184	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
72	NC_017184	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410921
73	NC_017184	GGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410921
74	NC_017184	ATA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410921
75	NC_017184	TGA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
76	NC_017184	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
77	NC_017184	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
78	NC_017184	TGT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410922
79	NC_017184	T	6	6	5035	5040	0 %	100 %	0 %	0 %	384410922
80	NC_017184	CGT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
81	NC_017184	GCC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
82	NC_017184	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
83	NC_017184	GCAG	2	8	5229	5236	25 %	0 %	50 %	25 %	384410922
84	NC_017184	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410922
85	NC_017184	GCC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
86	NC_017184	CAGGT	2	10	5413	5422	20 %	20 %	40 %	20 %	384410922
87	NC_017184	CTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
88	NC_017184	GAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
89	NC_017184	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410922
90	NC_017184	TC	3	6	5523	5528	0 %	50 %	0 %	50 %	384410922
91	NC_017184	CCG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
92	NC_017184	AAG	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
93	NC_017184	GCC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
94	NC_017184	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410922
95	NC_017184	CA	3	6	5688	5693	50 %	0 %	0 %	50 %	384410922
96	NC_017184	GCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410922
97	NC_017184	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410922
98	NC_017184	TTTCC	2	10	5899	5908	0 %	60 %	0 %	40 %	384410923
99	NC_017184	GA	3	6	5935	5940	50 %	0 %	50 %	0 %	384410923
100	NC_017184	GAGATA	2	12	5968	5979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384410923
101	NC_017184	ACG	3	9	5984	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410923
102	NC_017184	GTATTT	2	12	6244	6255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384410924
103	NC_017184	T	7	7	6264	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
104	NC_017184	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410924
105	NC_017184	ACCG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	25 %	50 %	384410924
106	NC_017184	AAT	3	9	6315	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
107	NC_017184	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
108	NC_017184	T	6	6	6492	6497	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
109	NC_017184	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
110	NC_017184	TGT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410924
111	NC_017184	CTTT	2	8	6573	6580	0 %	75 %	0 %	25 %	384410925
112	NC_017184	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410925
113	NC_017184	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410925
114	NC_017184	ATT	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410925
115	NC_017184	T	7	7	6648	6654	0 %	100 %	0 %	0 %	384410925
116	NC_017184	GTTT	2	8	6666	6673	0 %	75 %	25 %	0 %	384410925
117	NC_017184	AT	3	6	6683	6688	50 %	50 %	0 %	0 %	384410925
118	NC_017184	GTT	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410925
119	NC_017184	TTTAT	2	10	6734	6743	20 %	80 %	0 %	0 %	384410925
120	NC_017184	CATTTT	2	12	6793	6804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384410925
121	NC_017184	ATG	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410926
122	NC_017184	TGTT	2	8	7180	7187	0 %	75 %	25 %	0 %	384410926
123	NC_017184	AAG	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410926
124	NC_017184	CAA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410926
125	NC_017184	TA	3	6	7374	7379	50 %	50 %	0 %	0 %	384410926
126	NC_017184	CTT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410926
127	NC_017184	CATC	2	8	7476	7483	25 %	25 %	0 %	50 %	384410926
128	NC_017184	GCTT	2	8	7598	7605	0 %	50 %	25 %	25 %	384410927
129	NC_017184	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
130	NC_017184	TGA	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
131	NC_017184	ATCC	2	8	7721	7728	25 %	25 %	0 %	50 %	384410927
132	NC_017184	CTT	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410927
133	NC_017184	AGG	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410928
134	NC_017184	GA	3	6	8029	8034	50 %	0 %	50 %	0 %	384410928
135	NC_017184	CCAT	3	12	8038	8049	25 %	25 %	0 %	50 %	384410928
136	NC_017184	TTGAT	2	10	8085	8094	20 %	60 %	20 %	0 %	384410928
137	NC_017184	ATC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410928
138	NC_017184	CTGC	2	8	8172	8179	0 %	25 %	25 %	50 %	384410928
139	NC_017184	GCAGT	2	10	8190	8199	20 %	20 %	40 %	20 %	384410928
140	NC_017184	TTA	3	9	8238	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410928
141	NC_017184	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410928
142	NC_017184	T	6	6	8310	8315	0 %	100 %	0 %	0 %	384410928
143	NC_017184	TCC	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410928
144	NC_017184	CTT	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
145	NC_017184	CTT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
146	NC_017184	CCGC	2	8	8410	8417	0 %	0 %	25 %	75 %	384410928
147	NC_017184	GGC	2	6	8502	8507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
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151	NC_017184	CCTTGA	2	12	8698	8709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384410928
152	NC_017184	GAC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410928
153	NC_017184	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410928
154	NC_017184	GACT	2	8	8966	8973	25 %	25 %	25 %	25 %	384410928
155	NC_017184	CGG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
156	NC_017184	GCG	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
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158	NC_017184	AGGC	2	8	9421	9428	25 %	0 %	50 %	25 %	384410928
159	NC_017184	AAAGA	2	10	9432	9441	80 %	0 %	20 %	0 %	384410928
160	NC_017184	GAAGAG	2	12	9465	9476	50 %	0 %	50 %	0 %	384410928
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163	NC_017184	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410930
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166	NC_017184	CAT	2	6	10790	10795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
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175	NC_017184	CAT	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
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232	NC_017184	T	6	6	16415	16420	0 %	100 %	0 %	0 %	384410938
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249	NC_017184	AAC	2	6	17912	17917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410939
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251	NC_017184	TAC	2	6	17962	17967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410939
252	NC_017184	GCA	2	6	17976	17981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410939
253	NC_017184	GCC	2	6	18030	18035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.